MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL3

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011997	GAAA	2	8	90	97	75 %	0 %	25 %	0 %	222142647
2	NC_011997	A	6	6	148	153	100 %	0 %	0 %	0 %	222142647
3	NC_011997	TGA	2	6	201	206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142647
4	NC_011997	TA	3	6	221	226	50 %	50 %	0 %	0 %	222142647
5	NC_011997	GT	3	6	259	264	0 %	50 %	50 %	0 %	222142647
6	NC_011997	GAA	2	6	313	318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222142647
7	NC_011997	TTA	2	6	320	325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142647
8	NC_011997	TATT	2	8	350	357	25 %	75 %	0 %	0 %	222142647
9	NC_011997	CAA	2	6	365	370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222142647
10	NC_011997	A	6	6	369	374	100 %	0 %	0 %	0 %	222142647
11	NC_011997	TGGA	2	8	380	387	25 %	25 %	50 %	0 %	222142647
12	NC_011997	TAAA	2	8	395	402	75 %	25 %	0 %	0 %	222142647
13	NC_011997	A	7	7	448	454	100 %	0 %	0 %	0 %	222142647
14	NC_011997	AAC	2	6	483	488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222142647
15	NC_011997	AAAT	2	8	629	636	75 %	25 %	0 %	0 %	222142647
16	NC_011997	TGT	2	6	645	650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222142647
17	NC_011997	A	7	7	678	684	100 %	0 %	0 %	0 %	222142647
18	NC_011997	ATT	2	6	743	748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142647
19	NC_011997	GAA	2	6	760	765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222142647
20	NC_011997	A	7	7	764	770	100 %	0 %	0 %	0 %	222142647
21	NC_011997	ATT	2	6	778	783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142647
22	NC_011997	GAA	2	6	793	798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222142647
23	NC_011997	A	7	7	808	814	100 %	0 %	0 %	0 %	222142647
24	NC_011997	GGT	2	6	829	834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222142647
25	NC_011997	GAT	2	6	868	873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142647
26	NC_011997	GAA	2	6	907	912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222142647
27	NC_011997	A	6	6	911	916	100 %	0 %	0 %	0 %	222142647
28	NC_011997	GAA	3	9	925	933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222142647
29	NC_011997	ATT	2	6	977	982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142647
30	NC_011997	T	6	6	981	986	0 %	100 %	0 %	0 %	222142647
31	NC_011997	T	6	6	1011	1016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011997	TGTA	2	8	1089	1096	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011997	TAT	2	6	1101	1106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011997	TGG	2	6	1149	1154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011997	CAC	2	6	1194	1199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_011997	GTG	2	6	1225	1230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011997	A	6	6	1382	1387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011997	GGA	2	6	1443	1448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011997	C	6	6	1451	1456	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
40	NC_011997	GAG	2	6	1482	1487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011997	A	6	6	1583	1588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011997	A	6	6	1601	1606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011997	TAT	2	6	1609	1614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011997	GAA	3	9	1624	1632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011997	TAT	2	6	1669	1674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011997	A	6	6	1691	1696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011997	TA	3	6	1727	1732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011997	TATGT	2	10	1815	1824	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011997	TCT	2	6	1887	1892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011997	AAT	2	6	1911	1916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011997	T	6	6	1921	1926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011997	T	6	6	1968	1973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011997	GAAA	2	8	1979	1986	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011997	A	7	7	1996	2002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011997	TAT	2	6	2009	2014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011997	T	7	7	2051	2057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011997	GTTG	2	8	2084	2091	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011997	T	7	7	2092	2098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011997	ATTA	2	8	2124	2131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.